在某中学任教的理科教师城户诚（沢田研二 饰）看似悠闲自在，但是心中却有浓重的厌世情绪和反社会倾向。他白天认真授课，晚上则在自己的寓所进行一项惊世骇俗的研究。原来他竟在秘密制造小型原子弹，为此他不惜袭击驻地警察抢夺手枪，更潜入位于茨城县东海村附近的核动力研究所盗窃原料，以获得制造原子弹必须的钚和铈等重要元素。不久，他的作品顺利完成，城户扬言炸毁国会议事堂，并要挟政府按照他的指令行事。与之曾有一面之缘...

德川幕府时期，刽子手拜一刀（田村正和 饰）深得主公信任，然以柳生备前（橋爪功 饰）为首的柳生一族觊觎大权，因此视武功高强的水欧派剑客拜一刀如大敌。在正式比武前夕，备前设计陷害拜一刀，并杀害了他的妻子蓟（古手川祐子 饰），致令拜一刀挥刀而起，斩杀前来拘捕他的官差。在此之后，他与有着“暗里柳生”之称的柳生烈堂（仲代达矢 饰）相约决斗，最终取胜，于是获准带着儿子大五郎离开江户。从此，拜一刀化身为独行江湖...